私たちは、毎日の運動活性のリズムを記録するための手順を説明します<em>ショウジョウバエ</em>とその後のデータ解析。自発運動のリズムは、動物の概日時計の信頼性の高い行動出力され、概日変異体を研究するか、環境が概日システムを制御する方法を検証するときに時計機能の標準的な読み出しとして使用されています。
ほとんどの生命体は、内因性概日(≡24時間)ペースメーカーまたはクロックによって駆動される、細胞の生理学的および行動的現象で毎日のリズムを示す。人間の概日システムの機能不全は、数多くの疾患または障害に関連付けられています。容易に測定された行動のリズムが時計機能の読み出しとして使用されているそれによって概日リズムの根底にあるメカニズムの理解に向けた大きな進歩は、遺伝の画面から浮上している。 ショウジョウバエを用いた研究は、概日リズムの根底にある携帯電話や生化学的基盤の理解に精液の貢献をしてきた。読み出しショウジョウバエで測定された標準の概日行動は、自発運動です。一般的には、監視システムは、 ショウジョウバエの運動の動きを測定することができる特別に設計されたデバイスが含まれます。これらのデバイスは、暗室内にある環境的に制御されたインキュベーターに収容されており、小さな管の内側に含まれる個々のハエの自発運動を記録するために赤外光のビームの中断を使用してに基づいています。多くの日にわたって測定した場合、 ショウジョウバエでは、活動および非活動の毎日のサイクル、動物の内因性概日システムによって支配される行動リズムを示す。全体的な手順は、市販の自発運動の監視装置の出現とデータ解析のためのソフトウェアプログラムの開発を簡素化されています。我々はここで説明する手順で、現在世界中で使用される最もポピュラーなシステムですTrikinetics社、からシステムを使用してください。最近では、同一の監視装置は、 ショウジョウバエの睡眠行動を研究するために使用されています。多くのハエの毎日のウェイク睡眠サイクルを同時に測定し、連続的な自発運動のデータの1〜2週間価値があることができるため、通常は十分です、このシステムが変更さサーカディアンや睡眠の特性を顕在ショウジョウバエを識別するために大規模な画面に最適です。
このプロトコルでは、我々はショウジョウバエの自発運動のリズム、時計機能の標準的な読み出しとして使用されるフライ概日時計の信頼性の高い行動出力を測定するための手続きについて説明。このアッセイは、新規クロック突然変異体の大規模スクリーン(。などKonopkaとベンザー1971; Dubruille ら 2009)で使用されており、継続的に生体内での時計機能を細かく分析し、理解するために使用されます。また、最近の報告では、ビデオ、デジタル分析は、自発運動のリズム(Zimmerman氏ら、2008)を使用するよりも睡眠を定量化するには、はるかに信頼性があることを示唆していても、ハエの睡眠覚醒のサイクルを研究するために使用されています。睡眠を分析するために自発運動のリズムを使用する場合は、昼間の睡眠の割合が過大評価される傾向にある。
果物の行動表現型はそのような概日リズムと睡眠/休息活動として飛んでこのプロトコルの成功と再現性を確保するために、それは、年齢、遺伝的背景の類似しているアッセイハエに重要である、と同じ条件で飼育することは非常に敏感です。これらすべての要因に。単一の実験のために複数の保育器を使用する場合、それはいくつかの概日パラメータが温度の関数として変更される可能性があるので、すべてのインキュベーターでは、予想される温度であることを確認することが重要です。注意の1ワードハエを操作するための保育器の購入を検討し、すべてが平等ではないが作成されます。我々は多くのオプションがある特定のユニットをお勧めすることを躊躇しながら。 ショウジョウバエの仕事のためにインキュベーターを販売する会社を見つけるための優れたリソースは<www.flybase.org>で提供されています。一部の企業は、さらに追加機能は、すでにTrikineticsシステムと温度のランプ(例えば、Tritech)のために配線のような利用可能な特徴、" ショウジョウバエ概日"インキュベータを販売。重要な特徴は昼光制御とショウジョウバエの生理的な範囲で優れた温度制御のための機能が含まれています(〜15〜30℃)。保育器の価格とサイズは、多くの変化がTrikineticsから新しいアクティビティモニターで、さらに小さなインキュベーターは、これらのデバイスは、かなりの数を収容することができます。もし湿度(50〜70%で結構です)を提供するために、水で小さなパンを置くとしても、湿度が制御されているインキュベータを使用できますが、この追加機能は限り必要ありません。最後に、我々が日常的にこのプロトコルではデータ分析のためにFaasXと不眠症を使っているが、利用可能な別のプログラムやソフトウェアが(Rosatoとキリアコウ2006)がある、などClockLab(ActiMetrics)、ブランダイスのリズムパッケージ(D.ウィーラー、ベイラー医科大学、ヒューストン)、とMAZ(Zordan ら、2007)。
The authors have nothing to disclose.
この作品は、JCにI. EとNS061952にNIHの助成金NIH34958によってサポートされていました
Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
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Drosophila activity monitor (DAM) | Trikinetics Inc.; Waltham, MA | DAM2 or DAM5 | DAM2 monitors are more compact, and more can fit into a single incubator | |
Power supply interface unit (for DAM system) | Trikinetics Inc.; Waltham, MA | PSIU9 | Includes PS9-1 AC Power Supply | |
Light controller | Trikinetics Inc.; Waltham, MA | LC6 | ||
Pyrex glass tubes | Trikinetics Inc.; Waltham, MA | PGT5, PGT7, and PGT10 | ||
Plastic activity tube caps | Trikinetics Inc.; Waltham, MA | CAP5 | Yarn can be used instead of plastic caps. | |
DAM System data collection software | Trikinetics Inc.; Waltham, MA | Versions available for both Mac and PC | ||
FaasX software | M. Boudinot and F. Rouyer, Centre National de la Recherche Scientifique, Gif-sur-Yvette Cedex, France | Only for Mac | ||
Insomniac 2.0 software | Leslie Ashmore, Department of Pharmacology & Chemical Biology, University of Pittsburgh School of Medicine, Pittsburgh, PA | Runs on Matlab. Can be used on both PC and Macintosh. | ||
Environmental incubator with temperature and diurnal control, e.g. Percival incubator | Percival Scientific, Inc. | I-30BLL | Interior space dimension: Width: 65cm; Height: 86cm; Depth: 55cm | |
Environmental incubator with temperature and diurnal control, e.g. DigiTherm Heating/Cooling Incubator with Circadian Timed Lighting and Timed Temperature | Tritech Research, Inc. | 05DT2CIRC001 | Interior space dimension: Width: 36m; Height: 56m; Depth: 28cm | |
APC Smart-UPS 2200VA 120V (Emergency power backup unit) | APC | SU2200NET | Output Power Capacity of 1600 Watts | |
Sucrose | Sigma | S7903 | ||
Bacto Agar | Becton Dickinson | 214010 | ||
TissuePrep Paraffin pellets | Fisher Scientific | T565 | Melting point 56°C-57°C | |
Block heater | VWR | 12621-014 |