يبدأ تكرار الحمض النووي في المواقع التي تحتوي على تسلسل الحمض النووي المحدد مسبقًا والمعروف باسم أصول النسخ المتماثل. ويتم التخلص من الحمض النووي في هذه المواقع بواسطة هيليكاز صيانة الكروموسوم (MCM) وعوامل أخرى مثل Cdc45 ومركب GINS المرتبط. محمية ببروتين النسخ A (RPA) حتى يبدأ بوليميراز DNA في تصنيع الحمض النووي في النهاية 5’؛ للخيط في نفس اتجاه شوكة النسخ المتماثل. لمنع شوكة النسخ المتماثل من الانهيار، مجمع حماية الشوكة (FPC) يسافر مع الشوكة المتنامية. يمكن العثور على مركب البروتين المحفوظ في حقيقيات النوى ويتكون من بروتينات مثل Tim و Tipin و And1 و Claspin.
في المختبر ، يمكن إيقاف شوكات النسخ المتماثل بفعل هيدروكسي يوريا. يستنفد هيدروكسي يوريا التجمعات الخلوية لـ dNTPs ، والتي يحتاجها بوليميراز DNA لتخليق الحمض النووي. عندما لا تتوفر dNTPs ، يتباطأ تخليق الحمض النووي ويتوقف تماماً في النهاية. وبالتالي، فإن توقف شوكات النسخ المتماثل في الخلايا الحية يرتبط بخمول بوليميراز DNA.
يربط FPC نشاط البلمرة مع نشاط الهليكاز. لذلك، حتى عندما يتوقف البوليميراز، تستمر الهليكاز في تفكيك الحمض النووي لإنتاج فائض من الحمض النووي أحادي الجديلة (ssDNA) قبل أن تتوقف. يشبه ssDNA الزائد هذا الأجزاء المتدلية المقطوعة من إصلاح الكسر المزدوج الذي تقطعت به السبل. لتثبيت الهيكل، ترتبط بروتينات RPA بـ ssDNA وتوظف بروتينات ATR. ينشط ارتباط ATR بروتين منظم دورة الخلية Chk1 لمنع إطلاق أصول النسخ المتماثل وإيقاف دورة الخلية لإصلاح الحمض النووي. وبالتالي، فإن ssDNA بمثابة إشارة قوية تربط تلف الحمض النووي بالإصلاح.
