A Comprehensive Approach to Studying the Promoter Interactome in Scarce Cells

April 21, 2023

希少細胞集団におけるプロモーター中心の時空間ゲノム構造を研究するための統合ワークフロー

希少細胞の溶解と消化

希少細胞DNAのライゲーションと脱架橋

希少細胞DNAの超音波処理とビオチンプルダウン

希少細胞DNAのdATPテール、アダプターライゲーション、およびPCR増幅

希少な細胞DNAライブラリを使用したライブラリキャプチャ、ビオチンプルダウン、およびPCR増幅

Llorenç Rovirosa*¹, Laureano Tomás-Daza*^1,2, Blanca Urmeneta, Alfonso Valencia³, Biola M. Javierre⁴

¹Josep Carreras Leukaemia Research Institute, ²Barcelona Supercomputing Center, ³Catalan Institution for Research and Advanced Studies (ICREA), ⁴Institute for Health Science Research Germans Trias i Pujol

Summary

遺伝子発現は、遺伝子プロモーターと遠位調節要素との相互作用によって調節される。ここでは、低入力のCapture Hi-C(liCHi-C)により、以前は測定できなかった希少細胞型におけるこれらの相互作用の同定がどのように可能になるかを説明します。

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